mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAATTCAGTTC ACTGAGTTCGTTTGGTGGGT ATCCAAATCCATCCTTGGGTCACTGAGTTCGTTTGGTGGGTAGAAGTGTGTCCAATTCTCTAGCACCATTTGAATTCAGTTCATCCAAAGAGTTCG 4 2 3' arm Ixodes_scapularis mirbase 100 lgi-mir-29 0.0003 -30.9 ...........((.((((((.((((((((((..(((((((.((((.((....)).))))))..)))))..))))))))))..)))))).))..... (-30.90)