mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGTACTTCATCAGGTGCTCT GCATCTTTTGGAGTGCAAATG CAGTCACTAGTTAATTGTACTTCATCAGGTGCTCTGGAGTTCGGTTCGCACAACCAGGCATCTTTTGGAGTGCAAATGATAAGTGGCACG 3 1 5' arm Ixodes_scapularis mirbase mir-305 8e-45 ame-mir-305 0.000000004 -39.4 ..((((((.((((.((((((((((..((((((.((((.((.((...)).))..))))))))))..)))))))))).)))).))))))... (-39.40)