mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATTATGCTAGTGTTCGCGGG CGTGAACACAAGCGTGATACC GGCGCCAACCGCGTGAACACAAGCGTGATACCGTGCTAGGCTGGACTCGGGCATTATGCTAGTGTTCGCGGGGCTGGTTGC 3 0 3' arm Ixodes_scapularis mirbase 100 100 -40.7 .((((((.((.(((((((((.((((((((.(((.(((.....)).).)))..)))))))).))))))))).)).))).))) (-40.70)