mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGACCGTTACAATGGGCATG TGCCCACTGTCACGTTCACTGGG TCCTGGCCGCCTTGTGACCGTTACAATGGGCATGTTGGTCCACGTGCAGATGCCCACTGTCACGTTCACTGGGCGGAC 5 0 5' arm Ixodes_scapularis mirbase 100 cte-mir-2001 0.0009 -36.3 ......((((((.((((.(((.(((.(((((((.(((.........)))))))))).))).))).)))).)))))).. (-36.30)