mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGGAG CCGTGCTTCCTTACTTCCCATA GCGCCTTGGCGTGGGTTCCGTGCTTCCTTACTTCCCATAGTCAAATGACAAAACGTATGGAATGTAAAGAAGTATGGAGCAAATGCCGGGCCAT 4 0 3' arm Daphnia_pulex mirbase mir-1 0.00000000009 tca-mir-1 0.000000000005 -43.3 (.((((.(((((..((((((((((((.((((...((((((((....)))......)))))...)))).))))))))))))..)))))))))).. (-43.30)