mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AAAAAATCTCTAGTTCACCTAC GGCCTCCGGCTGTTGTGGTATGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTCGGCATAAAGACCGGTAACAAAAAATCTCTAGTTCACCTACCAAGGCAG 4 1 5' arm Daphnia_pulex mirbase mir-7 0.00000008 nlo-mir-7 0.000000005 -31.9 .........((((..(((((.((..((((((.((((((.((((((((........))))..)))))))))).))))))..)))))))..)))) (-31.90)