mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGAAGGGGCATGCAGTGGGA TCGCTGTTGGCCCTTTTTAAG CTGGGTTCGGTAGGAAGGGGCATGCAGTGGGAGATATTCCTGGGGTGCGTTTTAAGGTGGTCAAAGTCTCTGGGGTCTCGCTGTTGGCCCTTTTTAAGGAGAAGAA GACACGTGGTATGGGAGCTGGGCGCAAGCTCAAAACTCATCGAAGGAGGCAGAAGTGGGCTGACAAATCTTACAAGAAGAGCCATCTTGGCAACGAGTGGAAGAAGCCTTTCGCAGGTTCTTCTCATGCCAAGGGTATTGTTCTAGAGAAGATAGGCATTGAGGCCAAACAGCCAAACTCCGCTATTCGAAAGTGTGCAAGAGTTCAGCTTATTAAGAACGGAAAGAAGATTGCAGCATTCGTTCCCAACGATGGTTGTCTGAATTACATCGAGGAAAATGACGAGGTGTTGATTGCTGGGTTCGGTAGGAAGGGGCATGCAGTGGGAGATATTCCTGGGGTGCGTTTTAAGGTGGTCAAAGTCTCTGGGGTCTCGCTGTTGGCCCTTTTTAAGGAGAAGAAAGAGAAGCCTAGGTCATGAGTACCTTGTTTTTGTTTCCTCTGTATCTTTTATTTTGTTGTAGGGTGCACTTGCGAGGCAGTTCACCTCCCCCCTCTATTTTTGGCGTTTGCAAGAGTACGGGTAAGATTGATAAGATAAGCTTAACATTGGTCGAATTTTGGTCTTGTTCACATATTTTAAGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3 0 5' arm Amborella_trichopoda mirnest 100 100 -32.6 (((....)))..(((((((((..(((((((((.....((((((((.((.................)))))))))))))))))))..)))))))))........... (-32.6)