mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACGTGACACGTGACAGTCAA GATGGTCACGTGTCACGTTTG GTCTCTAATTTCGATTTTGATCTCTCTTTAAAATTATTCACGCATTGTCTTCCTTTTTTATTCAATCACGCACTCTTAGTTCCCAAGTCCAGATTTAGATATTGACTGTTACAAAAGAATATTGATGGTCACGTGTCACGTTTGATTGAACGATAATTGCCACTTGTTATGTTCTGATTGACCAATGATTACAAGAATGCATTTCATCGTCCATCGAGTCAACATCTCATGACACGTGACAGTTATCGTCCAATCAGAACGTGACACGTGACAGTCAAAATTCATTTGTAACCGTCAACGTCTAGATCTAGATTTGGAGATTAAGACTGAGTGATTGTATAAAAAAAAGACAAAATGCGTGAATAATTTGAAAGGGAGATCAAAATTGAAAATTAAAG ANNTTACAACAATCATGCATTTGGTACGAGCCCGGCAATCCAATTAGTAGGATTTAGGAGCATCAAATACATAAACTCACAGTGAGTAATGACAAATAATCAAACACAACACAAAAAGCAGAATACAAATTAAGTTTAAGCCAGGAGGGAGAAAAGATGAAAACCAAGCAATTAGGGTGGCGTAATTAATTGGCAAAATTGTAAATTTAGTTTTCGTAGTTGTCTCTAATTTCGATTTTGATCTCTCTTTAAAATTATTCACGCATTGTCTTCCTTTTTTATTCAATCACGCACTCTTAGTTCCCAAGTCCAGATTTAGATATTGACTGTTACAAAAGAATATTGATGGTCACGTGTCACGTTTGATTGAACGATAATTGCCACTTGTTATGTTCTGATTGACCAATGATTACAAGAATGCATTTCATCGTCCATCGAGTCAACATCTCATGACACGTGACAGTTATCGTCCAATCAGAACGTGACACGTGACAGTCAAAATTCATTTGTAACCGTCAACGTCTAGATCTAGATTTGGAGATTAAGACTGAGTGATTGTATAAAAAAAAGACAAAATGCGTGAATAATTTGAAAGGGAGATCAAAATTGAAAATTAAAGNNNACTAGGAGAACCAAAAATATAATNNNACCTAATTAATTAGCTAGGGACNNNNNCAAGGTCTTGGAGAAGGTATCAC 1 0 3' arm Glycine_max mirnest 100 gma-MIR1520o 0.00000000009 -177 ........(((((((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((..((((((((.(((((((.((.((((((((.(((((((.((((((((((.(((((.((((((((.((((.(((((.(((((((((((((((((((((.((((((((((.(((.(((((((....(((((((...((((.((..(((.....)))...))..)))).))))..))).))))))).))).)))))))))).)))))).))))))))))))))).))))).)))).)))))))).))))).)))))))))).))))))).)))))))).)).))))))).))))))))))))))..))))))))))))))).)))))))))))))))))))))....... (-177)