mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGTGTGGTTAGCTGGTTGTG CAGCCACTATCCAAACTGTCCAC GGGCAAAAGTGTATTGATGGTTGGCAGTGTGGTTAGCTGGTTGTGAAATATTTACTTGAATCCACAGCCACTATCCAAACTGTCCACTGTCGATGACACGA 3 1 5' arm Daphnia_pulex mirbase mir-449 0.000001 cte-mir-34 0.00000008 -40.63 ........(((((((((((((.((((((.(((.(((.((((((((.................))))))))))).))).)))))).))))))))).)))).. (-40.63)