mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATTGCACTCGTCCCGGCCTGC AGGCTTTGACTTGGGCAACTTCG ACCTTGATAGTCAACCTTATGAAGGCTTTGACTTGGGCAACTTCGTTTAAATGTTTGTCGAATTGCACTCGTCCCGGCCTGCTTAACTGGACTAAAAAAAC 7 1 3' arm Daphnia_pulex mirbase mir-92 0.00009 spu-mir-92c 0.00008 -23.52 .......(((((....(((...(((((..(((..(.((((.((((.............)))))))).)..)))..)))))...)))...)))))....... (-23.52)