mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCT GAGTGAATCTGAGAACACAAG CTCGGAGGAGTGAATCTGAGAACACAAGGCTGGTTTGCACTGCTATATCATCTATTGGTATAAGGTGAATTTACTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGAGCCAAC CTCGGAGGAGTGAATCTGAGAACACAAGGCTGGTTTGCACTGCTATATCATCTATTGGTATAAGGTGAATTTACTTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTTTGAGCCAACCTGTTGACATATACCAAAACATGAATCCTTCTCACTTTGCTTCTCATCTTTTTTTATCACCACATCTTGTTATAATGTCTTCAGATTTCAGGAAATGTTGCAGGCTGGATTTGTGGATGGTATAGACATCAATGTTGTTATTTTTATACTTCATTTTTTATACTTTAATTTCCTCTATACCTCACTTTTATTGGAGAAAAAAGAGAATAGAAAATAGTGGATTTCTCTTCTTTTTTTCAATCAAAGGGAGTTGTAGGGGAAAAGTTTAGAAAATGGCGTGTAAGAATAACATCATTGTGGAAATATA 1 1 3' arm Glycine_max mirnest MIR398 0.00000002 gma-MIR398a 2e-55 -43.1 ((((((((.((((.(((((((((((((((.(((....((((..(((((((.....))))))).))))...)))))))))))))))))))))).))))))))..... (-43.1)