mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGCTGAATCCGGGCCAAAT AAACAGAGCCCTGCTTTAGCTGGCTGAATCCGGGCCAAATTGTTATTCATAGAGCAGCATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGTTGGCATTCTGAGCAAC 4 1 3' arm Daphnia_pulex mirbase mir-133 0.000000000006 lgi-mir-133 0.00000000002 -40.3 ...(((((((..(((.(((((((.((((...(((((((((.(((.(((...))).))))))))))))..)))).))))))).))).)))..))))...... (-40.30)