mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTGTGACAGCCTCACT CAAAGGAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTACCTTTGGTTAGAGAGCTCAAGAGTGCTAACCCTGACTAGGTCATGCTGTGACAGCCTCACTCCTTCCTA GGAACATGAAACTGTTTAGATTGGAAGTTCGCAAAGGAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTACCTTTGGTTAGAGAGCTCAAGAGTGCTAACCCTGACTAGGTCATGCTGTGACAGCCTCACTCCTTCCTATTTGGGGACCCATTGTAGATTCTTCAACAATCTGAAAGACACACAAGGCTTAAAAAGCAAAAGGTAAGAAGCGAGTGATGAGCATGAGAAAATTCACTGCTAGCATCGTATATTCCTTTCTTTTCTTTTTTCTGAGTTTCTGTTCTGGCAGGCGTGCGTTATCAACTTTTCCCTTTTACTTGCTCTTGTCTTTTTCTTTTTTTTTTGCTACTTCTTTCACCGAACTAGTTCACTGTGTTATGTCTTTGGGACCAAACTTTTAAATTGATGGCCGTAGATTGCTCCTTATCTTTACTTAATTAGGGTTCCTACAACCCTAGGATGTTTATGTTATTCTAGTATCAAATTTATTCATTATGATTTTCTTTAGATTGGCTTGAATTTCTAAACCCTAGAGGTAGTTATTTTGATGTTTAAGTTGCTATGCATGTGTGAGTGTTATGTAGTGTTATGTGGAGTCATAGTTTATGCAGCTTAATATAAGACATGTTCCTCTTTTGTGTCCG 2 2 5' arm Glycine_max mirnest MIR167_1 3e-20 gma-MIR167a 5e-49 -39.3 ...(((((.(((((.((((.((((((((((((.....((((((...(((....))).)))))).....))))))))))))...)))).)))))..))))). (-39.3)