mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCGTTGTCGACGAAACCTGCA CGGGTTTCGCGACGCTCGAACG AATTGTGCCGTGCTTGTCCGGGTTTCGCGACGCTCGAACGCCGTTTACTTTCACAGTCCGTTCGTTGTCGACGAAACCTGCATATCGCACGGTCACTCT 2 2 3' arm Daphnia_pulex mirbase mir-981 0.000005 dme-mir-981 0.000001 -42.8 ....(((((((((.(((.((((((((((((((..((((((..((........))....)))))).))))).))))))))).)))..)))))).)))... (-42.80)