mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGCG CTCACAAAGTAACTGTGAAATG CTCACAAAGTAACTGTGAAATGTTGGTATATTGAGTCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCG 5 2 3' arm Acyrthosiphon_pisum mirbase mir-2 3e-28 isc-mir-2a 0.00000001 -18.5 ((((((((((..((((((.(((((.(.....).)).))).))))))...)))))).)))).. (-18.50)