mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGTATGAGCA CTCGTCAAAGTGGTTGTGAAACG CTCGTCAAAGTGGTTGTGAAACGTTCTGGTTTTCATTTTAAATTCAATTAATATCGTATCACAGCCAGCTTTGTATGAGCA 3 2 3' arm Acyrthosiphon_pisum mirbase mir-2 2e-39 der-mir-2c 0.00006 -25.24 (((((((((((((((((((.(((...(((((..............)))))....))).))))))))).))))).))))).. (-25.24)