mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGATATTGGTCCGGTTCAATA TTGAGCCGTGCCAATATCACG TGTTCAACGGGATATTGGTCCGGTTCAATAAGAAAGCAATGCTCAAAATGTTTTTGGGTCCTGTTTTTTCATTGAGCCGTGCCAATATCACGAACCAC ATTAGTACTCTCCCCTACCCCCAAGTGAAAAACATATAGGGCCCCTTCTGAATTTTTTTATCAATTGAGGTTTGAAATTTTTTTTTGTTTTTTTTTATAATTATTTTGATGCTTTTTTTGTGGTTGTTTTTGCAGCAGATGTGTGTAGAGAAAGTTTATAAGGCAAGCATGGTGGCAATGAGGGGTAGAGGTTATTTGTTCAACGGGATATTGGTCCGGTTCAATAAGAAAGCAATGCTCAAAATGTTTTTGGGTCCTGTTTTTTCATTGAGCCGTGCCAATATCACGAACCACTGCTCTTCATACCCCTGAAATCTTCTCATCATAGATGCTTCTTCTGTAATATATATGTTTTATGGGTACTTCGTCGGTGTAAATCAAACCTTTGTCTTATAATAATAAATATCAAATTGTTTTGGCT 3 0 5' arm Glycine_max mirnest MIR171_1 7e-24 gma-MIR171a 3e-50 -38.9 .((((.....(((((((((.(((((((((.((((((((..((((((((...))))))))..)))))))).))))))))).)))))))))..))))... (-38.9)