mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACGGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGAAG AAAATGGTGCTCTTTCTATTCTTCCACGGCTTTCTTGAACTGCATGGGCTTTGATCTATCAGATCTTTGTTTTTATATATAATCTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATAGAGAAAGGATCAGCA CGGGGGGCACACCACTTTTATAATACTTTGTGCTTCGTATGTTTTCAGAACCCTAATTAGGGTTTCCCTGAGGCAGAAGTGAAGAAGAGTCGAAACGTCTGCAAACAGCCATAAAAATGGTGCTCTTTCTATTCTTCCACGGCTTTCTTGAACTGCATGGGCTTTGATCTATCAGATCTTTGTTTTTATATATAATCTTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATAGAGAAAGGATCAGCATCAGAATGAAGAAGCAAACGTTTACATTATTTCTCTTTATTTAATTCGATTTTCATGATCTCTATATTCTTTGATTAATTTTTCTTTTTATGTGTTCGTTAGTTTTGGTTTATTTTTCTTAATTTCTCTGGTTAATTAAGTTTTAACTTGATATCAGTTCTGTGAGGTCTATGTATTTTTGGATTCTGGATTATACATCTAGCAACAGAATCTTTTGATTTTAAAA 1 0 5' arm Cichorium_intybus mirnest MIR396 0.000000008 mtr-MIR396b 0.0000000004 -47.9 ....((((.((.((((((((.((((((((((((.((((((((((.((((...(((((...)))))...)).............)).)))))))))).)))))))))))).)))))))).)).))))... (-47.9)