mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAACATTCAAAACTCCCTAC GGGGAGTTTTGAATGTTGTTGT GGGGAGTTTTGAATGTTGTTGTATAATATTTAAACAATTCAAAACATTCAAAACTCCCTAC 5 0 3' arm Acyrthosiphon_pisum mirbase 100 api-mir-3047-1 1e-23 -26.3 ((((((((((((((((((((((.((.....)).)))))....))))))))))))))))).. (-26.30)