mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGCT ACTCTCAAAGTGGCTGTGAAATG GGGCGTATTCTAGACTCTCAAAGTGGCTGTGAAATGGTTTTATTTTGCTCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTGGACTGCGCACC 1 3 3' arm Aedes_aegypti mirbase mir-2 4e-31 aga-mir-2-1 0.000000004 -45.6 (((((((.(((((.((((((((((((((((((.(((((........)).))).))))))))).)))))).)))))))).))))).)) (-45.60)