mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC CATCAAATTTGGTTGTTTTAGT TGCGTTGGCATCAAATTTGGTTGTTTTAGTACGACCTCTTTGAAACCCCTATCACAGCCAGCTTTGATGAGCAACGCA 5 0 3' arm Aedes_aegypti mirbase mir-2 9e-35 aga-mir-2-2 0.00000006 -28.61 .((((((.(((((((.((((((((..(((...................)))..)))))))).)))))))..)))))). (-28.61)