mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTATTCTAGCTGTAGA TAAAGCTTTAGTACCAGAGGTC CTGAATCTTTGGTATTCTAGCTGTAGAATGTTGAGCTTTGTGATATGGTATCTTCTAAAGCTTTAGTACCAGAGGTCCAACTG 3 0 5' arm Aedes_aegypti mirbase 100 aae-mir-9c 6e-42 -24.7 .((.((((((((((((..((((.(((((.((...(((.........))))).))))).))))..)))))))))))).)).... (-24.70)