mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTTGACTTCGGGTCAAAT CTCGGAATCGCTGAATATAGCTGGTTGACTTCGGGTCAAATCGTCAAATATTTGCAAAGATATTTCCTCAGTGAAATCATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCAGTGATGCATTACA 5 1 3' arm Aedes_aegypti mirbase mir-133 8e-55 cqu-mir-133 2e-33 -40.71 ....(.(((((((..(((((((((((((....((..(((((..((((((((((....))))))).......)))....)))))..))...))))))))))))).))))))).)...... (-40.71)