mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAAAAGGGACAGCAGAAAA CTCTGCTGTCCCTTTTCAAGT GCGACTTGGCTTCTCTGCTGTCCCTTTTCAAGTTGTTCCTGTATTGTCCCTTCGAAACAATATCGTTTTTATGATTTTTAAAATTGAATCACAATTAAATATTAATACAACGAGATAGTTTTGAATGGGAAGCACAAGGACAGCTTGAAAAGGGACAGCAGAAAAATCAGATCT GAGTTAATGGTAAAGGTGAGGAGGGCGACTTGGCTTCTCTGCTGTCCCTTTTCAAGTTGTTCCTGTATTGTCCCTTCGAAACAATATCGTTTTTATGATTTTTAAAATTGAATCACAATTAAATATTAATACAACGAGATAGTTTTGAATGGGAAGCACAAGGACAGCTTGAAAAGGGACAGCAGAAAAATCAGATCTATGACAAGAGTCTTTAGGTTCGTGGAGACAACGTCATAG 1 0 3' arm Glycine_max mirnest 100 gma-MIR4393b 0.0000000006 -69.5 ..((.((((.((.(((((((((((((((((((((((((.(((....((((((((((((.((.(((((.(((..((((....(((((.....)))))))))..)))...))))).)).)))))))).))))...))).))))))))))))))))))))))))).)).)))).)). (-69.5)