mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGTACTGAGTGACTCTCAG GAGAGCACCTCGGTATCTAAGC CATTCGCAATTTCACCGGTTCAGGTACTGAGTGACTCTCAGATGTGCATTTCTCAAGCAATCTCGTCCTCAGGACCTGAGGTTGAAAAACCCTGAGAGCACCTCGGTATCTAAGCCAGTGTTGCGAAAA 1 2 5' arm Aedes_aegypti mirbase 100 cqu-mir-306 0.00002 -54.7 ..(((((((...(((.((((.((((((((((((.(((((((...(((.........)))...(((.((((((...)))))).)))......))))))))).)))))))))).)))).)))))))))).. (-54.70)