mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGCTGGTGGTATCT ATACACCCTGTGCTCGCT GGAATTTCGGCTACCGGGATACACCCTGTGCTCGCTTTGCATTCGAAACTAGTGAACACAGCTGGTGGTATCTCAGTGGCCCTAATCC 1 3 3' arm Aedes_aegypti mirbase mir-317 5e-43 aae-mir-317-1 7e-45 -35.44 (((.((..((((((.(((((((((((((((.(((((..............))))).)))))..))).))))))).))))))..))))) (-35.44)