mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCCTTGTTGCAAACCTCACGC GTGTGCTTTGTGACAATGAG GCTGCGGGTGTGTGCTTTGTGACAATGAGATTCGGTTCGATATCATCCCCTTGTTGCAAACCTCACGCTTGCGGT 5 2 3' arm Aedes_aegypti mirbase mir-988 6e-36 cqu-mir-988 2e-23 -30.3 ((((((((((((.(.((((..((((.((((((((...))).))).))...))))..)))).).)))))))))))) (-30.30)