mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACCCTGTAGTTCCGGGCTTTT AAGCTCGTTTCTATAGAGGTATC AGCGCTCCTCCGTGACCTACCCTGTAGTTCCGGGCTTTTGTGGTTTCTTTTATTGTTAATTATCAGAAGCTCGTTTCTATAGAGGTATCTCACAGGGTGAA 3 1 5' arm Aedes_aegypti mirbase 100 cqu-mir-993 6e-27 -36.9 ..(((.(((..((((..((((((((((...(((((((((((((((............))))).))))))))))...)))))).))))..)))))))))).. (-36.90)