mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTAACTGTAAGACTGTGTCT ACGCGGTCGTGCAGGAAATTATT GCAGGGACGCGGTCGTGCAGGAAATTATTTGGCATTAGATTCAAATGTTAACTGTAAGACTGTGTCTTTGCGGGTGATC 3 1 3' arm Aedes_aegypti mirbase mir-999 2e-38 cqu-mir-999 1e-27 -34.1 ((((((((((((((.(((((..(((.((((((........)))))))))..))))).))))))))))))))........ (-34.10)