mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGATCTACTTAATACCCAT GGGTATTTTAGATCCTTGGCA ACTCCAATTCTGGGTATTTTAGATCCTTGGCATAGTTACGTGATTGAATGCACTGTTCTTCTTTGGTTTACCCAGTATCGAACACGCGTCAATCTGTCAGATCTACTTAATACCCATA 2 4 3' arm Aedes_aegypti mirbase 100 cqu-mir-1174 0.00002 -34.9 ..........((((((((.((((((..(((((.........((((((.(((..(((((....((((.....))))....))))).))))))))))))))))))))...)))))))).. (-34.90)