mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGTGGAGTAGTGGTCTCATCG AGATTCTACTTCTCCGACTTAA ACGATATGAAATAAGTGGAGTAGTGGTCTCATCGCTTAGTATTAGAAAAGTGAGATTCTACTTCTCCGACTTAATTCATATCTA 3 2 5' arm Aedes_aegypti mirbase 100 cqu-mir-1175 1e-40 -33.2 ..((((((((.(((((((((.(((((..((.((((((..........))))))))..))))).)))).))))).)))))))).. (-33.20)