mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACGTTACAGATTGGGGTTTCC TAATCTCAAATTGTAACAGTGGG GAGGTAATCTCAAATTGTAACAGTGGGTTGATTTTCCTGGTGAATCCCGGCCTTGTCCTCCGTCACAAGTGTGACAAGTGTCTCGAAAACGTGTTCGCTATACCCACGTTACAGATTGGGGTTTCCCC 2 1 3' arm Aedes_aegypti mirbase 100 cqu-mir-1889 0.00000000003 -42.7 ..((.((((((((.(((((((.((((((.(((....((((......))))....)))....(((((....))))).((((.(.((....)).)..))))..))))))))))))).)))))))).)).. (-42.70)