mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAATCTTTGATTAGGTCTGG AGAGCTAATTGGAGAGTTCTTG ATCGACATACGGCTAGAGCTAATTGGAGAGTTCTTGAATAGTGTTGTGAACCTTCATGAAATCTTTGATTAGGTCTGGTCGTGGTG 5 0 3' arm Aedes_aegypti mirbase 100 cqu-mir-1890-1 5e-24 -33.7 ....((.((((((((((.(((((..((((.(((.((((..((.......)).)))).))).))))..))))).)))))))))))). (-33.70)