mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGGAG CCATGCTTCCTTGCATTCAATA GAAGCAAAGCTGCGAAAGTTCCATGCTTCCTTGCATTCAATAGTATGTTTGTAAAACCCTATGGAATGTAAAGAAGTATGGAGCGATTGGGCTAGTTC 2 0 3' arm Anopheles_gambiae mirbase mir-1 3e-38 dmo-mir-1 5e-18 -36.7 .......((((.(((..((((((((((((.((((((((.((((...(((.....))).)))).)))))))).))))))))))))..)))))))..... (-36.70)