mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGTACGTGCT CATATACCCTTACTCTCCATC AACGACTTCTTTTTGAAGATATGGTTCATGCTGGAGAAGCAGGGTACGTGCTAAATCCATGATGTGATTTAGCATATACCCTTACTCTCCATCTTGAATCGGTTTCTTTAATTCTTCACAA ACCTACCCTGTCTACCCCTCAACCTCAAGGGAAGGTAACATTACATTCTAATTCTCTATATAACAATCTTATCACATCAATATAACCAACTTGTTTTGTTCTTTCTAAAGTATCCGTAACGACTTCTTTTTGAAGATATGGTTCATGCTGGAGAAGCAGGGTACGTGCTAAATCCATGATGTGATTTAGCATATACCCTTACTCTCCATCTTGAATCGGTTTCTTTAATTCTTCACAACGAAATCACAGGCGCTGGTGTACTTGAACACTGAATCAATCTGTCGTTCGTGGGGACAATACTGTCATTTTCTTGTTCTATCAGTCGGTAAAGTGCAAAGAATTTGGTGAGAGAGTCGTGGGGTTTTGAATGTGACGCCGATGAACAGAGTTCACCAAACATTCTGACATGAGTTTTTAAGAATAAAAAGAGTGTTAGATTTATTTTCTGTTTCAGTTCTTCTACACTGCATATAAAACAACTTACTGGAGGCATTTCACAAGATTTGCTGCTGTTATGGCTTCCTTTTGAGCTTCATCTGCTACAAGAGCAGCCAAAGTTTTCCTTCGAATCATTACCTTGTTATATTCAGACATTTAAACAATTCATTTTATTAAAATTTTCAAAATATCTTAACATTCAAACGGTCAAATTGGGCAAATTTTGAAACATACATTGGCAGGATTTTGCAGCTTAGAAGGCAGAGACGACCACGAAACAGTTTCTGGAAAGTGT 4 0 5' arm Cichorium_intybus mirnest MIR164 0.0001 ptc-MIR164f 0.000006 -41.4 ............(((((((..(((((((...((((((...((((((.((((((((((((...)).)))))))))).))))))...))))))...)))))))...))))))).......... (-41.4)