mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGGAG CCGTGCTTCCTTACTTCCCATA CCGGGCGATGCTGTTCCGTGCTTCCTTACTTCCCATAGTGGATGCGACGTATGGAATGTAAAGAAGTATGGAGCTGCGCCCGG 4 0 3' arm Apis_mellifera mirbase mir-1 3e-35 ame-mir-1-2 6e-42 -42.3 (((((((.....((((((((((((.((((...(((((((.(...).)).)))))...)))).))))))))))))..))))))) (-42.30)