mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGGTTACCGGAGTTA TGGCGCGGACATTTTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTATTATTCGACATCATAAAGCTAGGTTACCGGAGTTAAGCTCCTCGCCA 3 0 5' arm Apis_mellifera mirbase mir-9 8.0E-14 ngi-mir-9a 1.0E-27 -38.5 .((((.(((..((..(((((((.((((((((.(((((((........)).))))).)))))))).)))))))..))..))).)))). (-38.50)