mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTTTGGTAATCTAGCTTTATGA ATAGAGCTATATTACCAAAGTAA TAATGCTAGTGCTCTTTGCTTTGGTAATCTAGCTTTATGATCCTTAATTAAAATCATAGAGCTATATTACCAAAGTAAAGGCAAAAGCTTTG 1 0 5' arm Apis_mellifera mirbase mir-9 2e-27 ame-mir-79 2e-45 -43.1 ....(((..(((.(((((((((((((((.((((((((((((...........)))))))))))).))))))))))))))))))..))).... (-43.10)