mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCATTTTGATGAG CATCAAATTGGTTGTGGAATG ACCGAAATGAAAATACCTTTTGCGGTCCGATACATCAAATTGGTTGTGGAATGTTTCGAGTCATATCACAGCCATTTTGATGAGCTTGGCCCGCAGAATC 4 0 3' arm Apis_mellifera mirbase mir-2 5e-28 nlo-mir-13a 2e-27 -38.9 .................((((((((.((((..(((((((.(((((((((.(((........))).))))))))).)))))))...)))).)))))))).. (-38.90)