mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAATCAAGGAAATCACGGTCG ACCGTGTTTCCTTGGTTAACG GGTTTGATTCACTGCATCTTCTTAATCAAGGAAATCACGGTCGCGTGTGTGCCGGAAAGAAAGTGGCCTGTGATCTCCGGTTTCTCTTTCTCGACCGTGTTTCCTTGGTTAACGATATGTGCTGGATCATAG GGTTTGATTCACTGCATCTTCTTAATCAAGGAAATCACGGTCGCGTGTGTGCCGGAAAGAAAGTGGCCTGTGATCTCCGGTTTCTCTTTCTCGACCGTGTTTCCTTGGTTAACGATATGTGCTGGATCATAGGTTATACGTTCGCTGAACAATAATCGATTCTCTTTCTCTCTTTCTGATGTAATGATCCATTTGATTTTATTTTTTTATGCATAAACTATAAATCATGTTTTTCTTAGTGATCCACTCGGTTGCGATCTAATCCTTTTACCTCTTTCCCTTGTGTTGTGTTTGAAACTCGCTGAAGGTCCTTGATCTAGGTTTCACTTCAGTTACTTTTCGCTTTTCGTTTTATTTCGGTTATTGGTAACTAAAGACACATTGTTGTTCTGTTTAGGCTTTACTGTATTCGATTCGGGGAATTTTTTTAATCTGAATCTAGCCTAAGATTTAATCTCCAATTTCTTATTTTTCTTTTTTTATATGTTTATTAGAAATATATTTCGTGTTTACACAGATTCGATTAGGGTAATTCTTTGAAATCTGAAACTCGCGT 0 1 5' arm Glycine_max mirnest 100 gma-MIR1509a 2e-58 -46.9 ....(((((((.(((((.((.(((((((((((((.((((((((.......((((((...................))))))..........))))))))))))))))))))).)).))))).)))))))... (-46.9)