mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTGGCCTGCTAAGTCCCAA GGGCCTTAGTGGTCCTGTGGT AGGGTCGAAGAGTGAGTAAATGGCCGAGGGTGATTTGGGCCTTAGTGGTCCTGTGGTGGCTGCGTACGAATCCTACTGGCCTGCTAAGTCCCAAGTGATTCTCGGCTCGCGCTGCGATA 5 0 3' arm Apis_mellifera mirbase 100 hme-mir-193 0.00002 -51.81 ...((((.((.((((.......(((((((((.(((((((.(((((..(.((.((((.((...(....)..)))))).)).)..))))).))))))).))))))))))))).)).)))). (-51.81)