mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAGTACTAGTGCCGCAGGAG CCTGCTGCTCAAGTGCTTATCA AATCCTGTCTTGTTCATAAGTACTAGTGCCGCAGGAGTGACTAGGTTGGGTTAGAAATTACCATATCTCCTGCTGCTCAAGTGCTTATCAATGGGTCCGG 3 0 5' arm Apis_mellifera mirbase mir-252 5e-43 nvi-mir-252 3e-29 -35.36 ...((.(.((..((.(((((((((.(.((.(((((((...........(((.(....).)))....))))))).)).).))))))))).))..)).).)) (-35.36)