mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTGGGACTTTCGTCCGTTT CCGGATGAGGTCTTCATCGACC TCACGAGTAGTGTGTCCGGATGAGGTCTTCATCGACCGTGATTTAATTTCATAAGGTCGGTGGGACTTTCGTCCGTTTGCAAGACTCGAGGA 2 2 3' arm Apis_mellifera mirbase mir-278 5e-46 aga-mir-278 0.00000007 -44.4 ...(((((..((((..((((((((((((.((((((((((((.......))))..)))))))))))).))))))))..))))..))))).... (-44.40)