mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCATGGAGTTGCTCTCTTTGT AAAGAGAGCTATCCATCGACAGT CGACGAAAGGCGCGCGCTATAAAGAGAGCTATCCATCGACAGTATGGTTATAATAGACACTGTCATGGAGTTGCTCTCTTTGTAGACACTGCTATGTTCAACG 2 2 3' arm Apis_mellifera mirbase mir-281 0.000000001 ngi-mir-281 2e-21 -41.5 ....(((.((((.(.((((((((((((((..(((((.((((((...(((......))))))))))))))...))))))))))))).).)))))...))).... (-41.50)