mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGCTGGTGGTATCTCAGT AGGGAGCCACTCTGCGTTCACT GCTCTCGGAGAACAGGGAGCCACTCTGCGTTCACTCGGTGGGTAATGAAGCGGGTGAACACAGCTGGTGGTATCTCAGTTTTCTGAGGGC 2 3 3' arm Apis_mellifera mirbase mir-317 8e-45 nvi-mir-317 2e-39 -49.4 (((((((((((((.(((((((((((((.(((((((((.(.........).))))))))).)))..)))))).)))).))))))))))))) (-49.40)