mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGATTCACTCCTCCAACTTAC AAGTGGAGAAGTGGTCTTTACGCT CAAAAATAAATAATATGCAAGAAAGGGATTATGGTTCAAGTGGAGAAGTGGTCTTTACGCTTTGAATTAAAGTGAGATTCACTCCTCCAACTTACTCCTGATCCCTAATATTCTTCGTTTTTTTTTTTTATTTGTTTC 3 5 3' arm Apis_mellifera mirbase 100 bmo-mir-1175 0.0001 -40 ...((((((((((.(((.(((((((((((((.((...((((((((.((((((((...(((((((...)))))))))).))))).)))).))))...))))))))))....)))))))).........)))))))))). (-40.00)