mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATGGTTTAATGCTGGTGTAA CAAGGCAACAAACCATCAG ATATATGTAGATGAGGAAGATGGTGAACTATCATGGTTTAATGCTGGTGTAAGAGTTGGTGTTGGAATTGGGCTTGGCTTATGTGTAGGAGTTGGTATAGGAGTTAGCTTGTTAGTACGCTCATACCAAGCAACTACTCGTAATTTTAAGAGGAGGTTCATATAATATACCCCTCAAGAGTTTGAACTTATATGCTCTATATCTTCAAGGCAACAAACCATCAGTGGTATTTTTTTCCCCCTTCATAAGTCT ATTACAACAGCATGTATTGCCAAAGAACAATATATGTAGATGAGGAAGATGGTGAACTATCATGGTTTAATGCTGGTGTAAGAGTTGGTGTTGGAATTGGGCTTGGCTTATGTGTAGGAGTTGGTATAGGAGTTAGCTTGTTAGTACGCTCATACCAAGCAACTACTCGTAATTTTAAGAGGAGGTTCATATAATATACCCCTCAAGAGTTTGAACTTATATGCTCTATATCTTCAAGGCAACAAACCATCAGTGGTATTTTTTTCCCCCTTCATAAGTCTTTAAAGAATGTTCTTGTTTCAAAGGATGGCATAGATGCTTAAATTTTGTCATCATGATGGGTTGACATCCATTGTGTGATTGATTGTGTAGGTTGTAACTAGCACATAAAAAGCGTTTTCATGTAAATGGTCAAAAAAAATATTGCTACCAAAAAAAA 4 2 5' arm Glycine_max mirnest 100 100 -52.1 ...((((.((....((((((.((((.(((...(((((((..((((..((.((((..(((.((.((..((((((((((.(((((.((((..((((((((..((((..(((....)))..))))))))))).)..)))).))))).))...((((.(((...........)))))))..)))))))).)).....)).)))..)))))).))))..))))))).)))..)))).))))))..)).))))..... (-52.1)