mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACTCACGTCGACTGGGTGTCCGC GGAGGCTAGTTATGACGGAGGGTCT GGCTACTCGGAGGCTAGTTATGACGGAGGGTCTGAGAGCGGGGGTTCCTGTTGGTGCGGGACTCACGTCGACTGGGTGTCCGCGCTAAGCTC 3 5 3' arm Apis_mellifera mirbase Metazoa_SRP 5e-46 100 -34.1 ((((.(.((((.(((((((..(((((((..((((..((((((....))))))....)))).))).)))))))).))).)))).)...)))). (-34.10)