mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTTGTGACCGTCACTAACGGGCAGT TTGCTCGTTTTGGCGATCGCAAAATGA GGCTGTTGTTAGGCGAAGTTGGTTTGTGACCGTCACTAACGGGCAGTGTTAATACGGTTGCTCGTTTTGGCGATCGCAAAATGAACTCGCTTGAC 3 3 5' arm Bombyx_mori mirbase mir-274 5e-46 100 -39.6 .......(((((((((.(((.((((((((.(((((..((((((((.(((....))).).))))))).))))).)))).)))).)))))))))))) (-39.60)