mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATGCACTATCTGGTACGACA CGTGCCAGGAGTGCGTTTGCA TTGATTACGCCTCGGGGTTCGTGCCAGGAGTGCGTTTGCAAAGAGGCCGACATGTTTGCGTTATTGCAATGTTAACACTGTAAATGCACTATCTGGTACGACATCCCGGGGCGTGTAGCAAC 1 1 3' arm Bombyx_mori mirbase mir-277 1e-62 ame-mir-277 0.000000002 -63.4 (((..(((((((((((((((((((((((((((((((((((.....(..(((((...((((....)))))))))..)..)))))))))))).)))))))))).)))))))))))))...))). (-63.40)